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23魔方affy芯片族源分析产品¥499

前段时间计划的芯片众筹取消,实验室未必可以控制在这个价格区间内。消费级产品估计很快进入彻底的烧钱大站。

刚刚与魔方ceo周总沟通,可以向发烧友开放raw data数据下载。最好统一组织一下,统一要,否则不好对接。

周总介绍,ydna覆盖4万snp。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
本帖最后由 风虎云龙 于 2017-4-18 21:37 编辑

论坛里知道这个产品的人还是很少,问了一下他们,说芯片的Y-SNP是按照2017版ISOGG的树做的,放了五万多个位点进去,对于想花最少的钱,就能确定自己是哪个现有的最下游子类型的朋友来说,确实是个很利好的产品。

现在祖源产品很多,大家可能很糊涂,不知道都测的是些什么,这个需要给大家解释一下。这个测试类似于复旦之前搞得Y染色体中通测试(源基因标准版是1800个Y-SNPs位点,微基因是18956个Y-SNPs位点,23魔方祖源产品是5万多个Y-SNPs位点),我刚刚也订了份这个499的祖源产品看看效果如何,出结果了和大家说一下。
F444交流群:293164533
Y高通测试报名QQ群:602612059
2# 风虎云龙
源基因的SNP点位比微基因少,为什么我看别人的报告里,源基因可以测到微基因下面两层?
2# 风虎云龙
源基因的SNP点位比微基因少,为什么我看别人的报告里,源基因可以测到微基因下面两层?
双头鹰 发表于 2017-4-18 19:50
要具体举例才好讨论。
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Y高通测试报名QQ群:602612059
要具体举例才好讨论。
风虎云龙 发表于 2017-4-18 20:29
嗯,目前好像还没有同时做了微基因和源基因的,但我们C群里一个F948和一个M407都做到了下面两层,目前微基因只能见到F948和M407这一层的结果,下游虽然有树,但无结果,可能树还不太一样,源基因好像是复旦自己的树
与snp位点的选择有关,如果都选择了MAF>5%的snp,选多少也测不深,而且限于芯片的准确率一直很不理想,高密度芯片,很可能会严重降低准确率。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
其实,理想的设计是,在源基因1800snp的基础上,把1000G东方样本的private snp都拼上,这样就可以降低密度减少错误率,又可以在当前树的基础上分到最细,甚至可以判断跟哪个一个具体样本关系最近。
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新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
又与23魔方沟通了一下,看来把raw data作为常规分享项目,他们还没想好。这样,发烧友众筹,还是要自己组织一下。折合各种费用,预计要比499贵出一百,¥599,保证测试失败可以免费重测。
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