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蒙古古DNA:F845+和F3830+

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发表于 2020-2-22 14:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-2-22 16:19 编辑

Ancient DNA reveals two paternal lineages C2b1a1b1a/F3830 and C2c1b/F845 in the old nomadic people distributed on the Mongolian Plateau
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB33265

第一个样本跑出来了。
DM10000521 [ERR3404620 古代游牧民族 蒙古]
http://www.myroots.top/index/tree/ysnp_tree.html#C2a1a1b1a|DM10000521
https://www.yfull.com/tree/C-F3830/

全血统,如附图,比DA39北匈奴甲型大墓组,略北一点。对比第二张卡尔梅克蒙古样本。


ERR3404620 Mongol.png
Kalmykia Mongol.png

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发表于 2020-2-24 18:54 | 显示全部楼层
本帖最后由 cwqjack 于 2020-2-24 20:53 编辑

那个f845跑计算器的结果据说跟现代湖北人差不多,反正不是什么蒙古族了。 -19528739536e2e72.jpg

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发表于 2020-2-25 20:52 | 显示全部楼层
这么快就改口,自己打自己脸不开心吗
 楼主| 发表于 2020-5-16 01:28 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-5-16 01:33 编辑


嗯,终于出来了。

果真蒙古国的柔然、鲜卑、室韦,都是C3北支F1756,内蒙古的都是C3南支F845。且内蒙古的F845+包含最早期的分化类型,朱开沟文化北狄期、七郎山鲜卑期、一棵树蒙古期。

Among the six sites (Figure 1),the Khermen Tal (TL1, Rouran period), the Zaan Khoshuu (ZHS5,Xianbei period), and the Gangga (GG3, Shiwei period) have been pre-viously studied (Li et al., 2018). The other three sites are the Yikeshu(YK15), Qilangshan (QL11), and Zhukaigou (ZK3022), all of which arelocated in Inner Mongolia, China. The Yikeshu site lies northwest ofancient Shangdu City in Zhenglan Banner, Xilingol League.

F845.png
F845 F1756.png

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 楼主| 发表于 2020-4-23 16:27 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-4-23 16:54 编辑
tommysung 发表于 2020-4-23 16:24
蒙古国鹿石文化古DNA已经放出来了,与东亚M120只有4000多年共祖,而东庄类型的M120已经五六千年了,先把 ...


ARS015:蒙古国西北青铜时代鹿石文化的Q-M120样本

http://www.ranhaer.com/forum.php ... &extra=page%3D1

yfull对现代样本的最近共组年代估算是TMRCA 4400 ybp,青铜期前夜,这个样本的年代是1380–975 BCE,青铜期。M120的最近共组年代为TMRCA 6100 ybp,新石器时代。可见M120虽然最近共组深至新石器时代中期,但从西伯利亚迁徙到东亚地区的年代则在青铜期前后,甚至更晚的历史时期。

https://www.yfull.com/tree/Q-Y515/

Q的情况现在基本清楚了,蒙古国西部鹿石文化基本上是QxM120为主,少量M120,与南西伯利亚相似;而蒙古国中东部的石板墓文化M120是核心大簇,附带一定新石器时代蒙古中北部的土著C北支F1756+等。可见,M120更似美洲的M3,奠基人效应,起源于南西伯利亚,进入漠北的Q以M120为主,再通过漠北进入漠南以及东亚。成为东亚三千年以来的头部超级大簇。

外蒙古的父系也即基本清晰,新石器时代,C北支为主;青铜时代,西部区大量注入南西伯利亚的Q/R等;中东部Q-M120一支独大与C北支并驾齐驱。匈奴时代,阴山河套地区的O系F5+F46+F11等东亚常见簇大量注入漠北。

中心在内蒙古长城沿线的庙子沟文化陕北五庄果梁据悉C南F845+是核心大簇,这样,越来越接近我最初的推测,新石器时代,C北支主要富集于漠北,C南支富集于漠南。青铜时代,R进入南西伯利亚引发多米诺骨牌效应,Q系大量注入漠北,特别是M120,进而迫使晋陕蒙高原地带的C南支进入中原地区,与考古上,石峁文化引入陶寺文化区域,对应禹出西羌,古羌在晋陕之间,而唐伐西夏,迫使禹族进入嵩山南麓,其后,禹征三苗,又最终消灭了长江流域的石家河文化,F845+在长江流域的小分支应当是禹征三苗的结果。

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 楼主| 发表于 2020-2-25 21:37 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-2-25 21:38 编辑
cwqjack 发表于 2020-2-24 18:54
那个f845跑计算器的结果据说跟现代湖北人差不多,反正不是什么蒙古族了。


大美基因器,F845+样本的了类西伯利亚雅库特血统高达27.7%,要高于北匈奴甲型大墓的22%,高于内蒙古地区的15-20%,更高于华北汉族的3-5%。


发表于 2020-2-25 13:04 | 显示全部楼层
cwqjack 发表于 2020-2-24 18:54
那个f845跑计算器的结果据说跟现代湖北人差不多,反正不是什么蒙古族了。

蒙古高点,但是东亚跟中国南方人特别像土家族
 楼主| 发表于 2020-2-23 14:49 | 显示全部楼层
MNOPS 发表于 2020-2-23 13:09
想请教永老师一个问题,为什么这个古代蒙古游牧民族样本类柬埔寨成分会这么高,按理说不应该啊。是不是这里 ...

所有的中亚人、欧洲人都有很高的类柬埔寨成分,倒过来,东南亚人也有很高的类西伯利亚成分。具体原因尚不清楚,怀疑,与未加入高加索人种对照组有关,而东南亚与西伯利亚都有很高比例的类高加索人种成分。
 楼主| 发表于 2020-2-23 10:17 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-2-23 10:25 编辑

跑出来了。F845+样本跑出来了。F13563,属于这个分支。
IMG_20200223_101532.jpg
IMG_20200223_101458.jpg
IMG_20200223_102111.jpg
IMG_20200223_102529.jpg
 楼主| 发表于 2020-5-16 01:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-5-16 02:03 编辑
Yungsiyebu 发表于 2020-5-16 01:28
嗯,终于出来了。

果真蒙古国的柔然、鲜卑、室韦,都是C3北支F1756,内蒙古的都是C3南支F845。且内 ...


C南支F845+的七郎山鲜卑,与除了与南戈壁汉军样本类似的强高加索信号外,你与现代人比,如果用低分辨率计算器的话,确实怎么看都像南方人。古今差异如此巨大,让万古一系派难以接受吧?

K7b
South_Asian        West_Asian        Siberian        African        South_European        Atlantic_Baltic        East_Asian
0        0        0.1002        0        0        0.0666        0.8332

E11
非洲        欧洲        印度        马来        傣族        彝族        东亚        日本        鄂伦春        雅库特        美洲
0        0.1111        0        0        0.2655        0.1135        0.5099        0        0        0        0

Hapmap K6
YRI        TSI        MKK        LWK        CEU        JPT
0        0.0989        0        0        0        0.9011

191ancient_Asian K7
Boisman        Afanasievo_A        Mongolia_Neolithnic        Taiwan_Historic        Jomon        Afanasievo_B        Taiwan_Neolithnic
0.0808        0.1136        0.286        0.1117        0.0295        0.1112        0.2673

但如果用hgdp_K10计算器,则完全不同,可以发现显著的类雅酷特血统因素。

qilangshan_xianbei.png
发表于 2020-4-23 22:22 | 显示全部楼层
tommysung 发表于 2020-4-23 14:48
《周书。蛮传》载:“蛮者,盘瓠之后,族类蕃衍,散处江、淮之间,汝、豫之郡。凭险作梗,世为寇乱。逮魏人 ...

     出土文物一:北魏时期传奇人物--- 襄阳盘觚蛮女酋长、北魏孝明帝淑仪之母、蛮族首领雷氏文夫人墓志铭记

夫人姓文,字罗气,南阳人也。其先盘觚之苗裔,曾祖/钦,晋司徒公。祖虎龙,魏太武皇帝太延三年秋七月,/帝以龙承勋望胄,文武超群,诏除冠军将军、梁城镇/将、鲁阳侯。真君五年春三月,帝以龙镇捍有方,威名/肃振,诏迁洛州刺史,在任薨俎。嘉其诚绩,谥粤恭公。父稚清,献文皇帝延兴三年夏四月不幸早终。夫人/望斑乡鼎,贞节昭著,礼从降适雷亥郎为妻,时郎太和廿四年鲁阳太守石公辟为中正,令充乡道,鸦左/信服,远近祗肃。世宗宣武皇帝景明之季,因乡人逆/乱,横染徒党,文唯与儿魏伏波将军、薗池丞暄,携抱/孤遗,俱坠宫禁。女刘贵华挺胄谯国,窈窕美称,正光/之世,孝明皇帝聘为淑仪。嫔敬上抚下,光扬椒闺,不/幸花叶早落。文弟翘,圣世尝食典御,遇病殒丧,元象/二年九月从龙骧将军,诏赠广州刺史。文春秋七十/有一,殒于邺都德宫里。大魏武定五年岁次丁卯二/月戊辰朔十七日甲申,窆于邺城西豹寺之南公田/之际。龙轜将引,方相启途,亲朋痛切,号感行云。见者/流泪,闻者酸心,送尸而往,迎神而来。呜呼窀穸,恒夜/□□,其词曰:○墓门一闭,地户永关,深灯絶灭,有去不还。
     出土文物二 ------ 文夫人同祖父堂弟《问度墓志》
     故中常侍、中尝食典御问度,字延度,广州鲁阳石台人也。导/源江汉,分㟧嵩华,盖周姬之苗胄(自认华夏,不过用了一个‘盖’字,呵呵)。汉骠骑大将军、散骑常侍、/使持节、司豫二州刺史、汝南公敞之后。汉昭帝使持节、前军/将军、兖州刺史、源阳侯彻之玄孙。曾祖定能,魏天兴年中,瀼/沔搔扰,扇连中夏,祖率领乡酋以安静之,私厌世荣,保壁自/固,潜居不仕。
   (北魏)高祖盛兴,真君年中,鲁阳之民险如难御,祖乃/乘彼轩輏,秉兹耄节,亟陈成败,押如伏之。祖虎龙,正平年中,/以祖英略有闻,文成皇帝召赴平城都。帝问左俗之事,答诏/有能。上甚嘉辩,尔可心膂驱使,戎威若举,委以前驱。释褐直/合将军。祖勤恭帝侧,除龙骧将军、雍州刺史。后除冠军将军、/梁城镇将、鲁阳侯,在任身丧。帝思忠节,赠使持、洛州刺史,谥/曰恭侯。父猛,除大都督李崇下千人军主。蠢尔蛮荆,大邦之/雠,恐更充斥,合乡拥移晋阳(注:是“合乡”迁移)
     景明年初,伯父石他思恋乡廛,/率领移徒,安尔还乡为国,以无旨放,拟比逆节,没为官人。小/心敬公,永熙年中,释褐为黄门丞。兴和年末,为慕容献牒为/中兵参军。武定年中,献武皇帝召为郎中令,帝嘉劳止。天保/年中,除中甞食典御,在公勤恪。皇建元年,除中常侍,仍典御。/而六龙难顿,再中无感,春秋六十四,大宁元年十二月廿七/日,卒于晋阳。帝念勤劳,....,发自□年,慷慨之心,笃于/壮岁。冀穷遐䄒,毕一生之意气,有志无□,奈何命也。




     上面蛮族首领文家的情况,可以折射华中地区华蛮身份变化的有趣情形,呵呵
发表于 2020-2-23 00:31 | 显示全部楼层
哈哈,老永好样的,又给了黄汗一记响亮的耳光。最开始黄汗说F845是西南起源的是西南土著,可去年那篇河南禹州论文测出河南仰韶龙山时期的F845就已经打他们的脸了,现在古代蒙古游牧民族测出F845更是把黄汗羞得无地自容。在我看来这更加证实了我的推测,既不论C2北支还是C2南支最初都是北方起源的,南下也就是青铜时期之后的事。
发表于 2020-2-23 13:09 | 显示全部楼层
想请教永老师一个问题,为什么这个古代蒙古游牧民族样本类柬埔寨成分会这么高,按理说不应该啊。是不是这里的柬埔寨成分实际指的是一种西欧亚成分,因为据我所知柬埔寨人似乎有部分从南亚过来的西欧亚成分。而古代蒙古高原游牧民族有部分西欧亚成分也说得通。
发表于 2020-2-24 11:54 | 显示全部楼层
YK15 SAMEA5745440
QL11 SAMEA5745439

这两个似乎都是C2b1b1b2a2~


20200224115357.png

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发表于 2020-2-24 12:19 | 显示全部楼层
QQ图片20200224121451.png

Yleaf_out.7z

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 楼主| 发表于 2020-2-24 12:23 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2020-2-24 12:25 编辑
foye 发表于 2020-2-24 11:54
YK15 SAMEA5745440
QL11 SAMEA5745439


大美基因的计算器,只分到:

C2a1a1b1        7452675        F9838        G
C2a1a1b1        7452675        FGC28847        G
C2a1a1b1        7452675        Y11619        G
C2a1a1b1        8504667        FGC28856        t
C2a1a1b1        8504667        Y11603        t
C2a1a1b1        8504667        Z30401        t
C2a1a1b1        11509721        FGC28873        A
C2a1a1b1        11509721        Z30411        A
C2a1a1b1a        12233774        FGC28884        T



https://www.yfull.com/tree/C-F3830/
发表于 2020-2-25 19:50 | 显示全部楼层
你的名字 发表于 2020-2-25 13:04
蒙古高点,但是东亚跟中国南方人特别像土家族

土家族F845挺高频的是藏缅语族,土家语也有黏着语特点跟南方其他语言不太一样,我认为土家族的祖先应该是北来的。
发表于 2020-2-25 19:52 | 显示全部楼层
有没有人知道这例古代蒙古F845样本是什么年代的?如果是近代的话更可能是中原影响,如果是比较早期的话那就有意思了。
发表于 2020-2-25 21:49 | 显示全部楼层
马来语也是黏着语,看来马来语也是秦岭淮河以北来的
发表于 2020-2-26 07:13 | 显示全部楼层
bacerlona 发表于 2020-2-25 21:49
马来语也是黏着语,看来马来语也是秦岭淮河以北来的

北部土家语除了有黏着特征之外,句子结构也是SOV的,跟北方民族语言一致。马来语据我所知不是SOV。
发表于 2020-2-26 07:15 | 显示全部楼层
Yungsiyebu 发表于 2020-2-25 21:37
大美基因器,F845+样本的了类西伯利亚雅库特血统高达27.7%,要高于北匈奴甲型大墓的22%,高于内蒙古地 ...

老永知道此例样本的年代吗?

但如果类西伯利亚雅库特血统高达27.7%,应该可以排除晚近中原的影响。
发表于 2020-2-26 10:15 | 显示全部楼层
Yungsiyebu 发表于 2020-2-25 21:37
大美基因器,F845+样本的了类西伯利亚雅库特血统高达27.7%,要高于北匈奴甲型大墓的22%,高于内蒙古地 ...

myroot网站,我试过传一个只有Y+MT的BAM  也会有计算器结果   很奇怪。建议把F845上传GEDMATCH 才有说服力。
 楼主| 发表于 2020-2-26 14:16 | 显示全部楼层
foye 发表于 2020-2-26 10:15
myroot网站,我试过传一个只有Y+MT的BAM  也会有计算器结果   很奇怪。建议把F845上传GEDMATCH 才有说服 ...


原始的BAM文件,是有常染色体信息的,且往往比Y高好多倍,除非滤过了。捕获没有那么精准。gedmatch无法处理sra/bam/fastq等原始数据,跑不了。


 楼主| 发表于 2020-2-26 14:18 | 显示全部楼层
MNOPS 发表于 2020-2-26 07:15
老永知道此例样本的年代吗?

但如果类西伯利亚雅库特血统高达27.7%,应该可以排除晚近中原的影响。

不清楚,搜不到文献,好像是匈奴人。基因比鹿石文化明显偏内蒙古。
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