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青海蒙古族的自然选择和表型变异的基因组分析

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发表于 2013-7-28 10:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
Genomic Analysis of Natural Selection and Phenotypic Variation in High-Altitude MongoliansAbstractDeedu (DU) Mongolians, who migrated from the Mongolian steppes to the Qinghai-Tibetan Plateau approximately 500 years ago, are challenged by environmental conditions similar to native Tibetan highlanders. Identification of adaptive genetic factors in this population could provide insight into coordinated physiological responses to this environment. Here we examine genomic and phenotypic variation in this unique population and present the first complete analysis of a Mongolian whole-genome sequence. High-density SNP array data demonstrate that DU Mongolians share genetic ancestry with other Mongolian as well as Tibetan populations, specifically in genomic regions related with adaptation to high altitude. Several selection candidate genes identified in DU Mongolians are shared with other Asian groups (e.g., EDAR), neighboring Tibetan populations (including high-altitude candidates EPAS1,PKLR, and CYP2E1), as well as genes previously hypothesized to be associated with metabolic adaptation (e.g., PPARG). Hemoglobin concentration, a trait associated with high-altitude adaptation in Tibetans, is at an intermediate level in DU Mongolians compared to Tibetans and Han Chinese at comparable altitude. Whole-genome sequence from a DU Mongolian (Tianjiao1) shows that about 2% of the genomic variants, including more than 300 protein-coding changes, are specific to this individual. Our analyses of DU Mongolians and the first Mongolian genome provide valuable insight into genetic adaptation to extreme environments.
文章链接:http://www.plosgenetics.org/arti ... ournal.pgen.1003634
发表于 2013-8-3 18:28 | 显示全部楼层
47# akuan333

南方基本上都是一两个祖先,一个村落吧,北方就是一个村落多个祖先,多个姓氏。

像我们这里就基本上是明末战乱迁徙过来的祖先,然后定居发展成一个个村落。
当然也有更大的村落是明代以前的世家,但是也是一个姓氏发展起来的。

南方基本是安定地区,所以发展成这样,对基因的影响是很大的。
 楼主| 发表于 2013-7-28 10:24 | 显示全部楼层
本帖最后由 风虎云龙 于 2013-7-28 10:34 编辑

天骄一号爆出冷门,基因采样的成年蒙古族男子系成吉思汗黄金家族的34代孙,具有完善的家族系谱记录,且没有和外族通婚史,这个就是老永说的什么王爷吗?
Y检测的结果是Q1a1.
天骄一号Y.png
天骄一号线粒体.png
发表于 2013-7-28 10:34 | 显示全部楼层
不是,内蒙古王爷的天骄一号头衔被抢了,这位是58岁的德都蒙古老人。
 楼主| 发表于 2013-7-28 10:44 | 显示全部楼层
资料说青海省境内的“德都蒙古人”,主要是成吉思汗及其弟弟哈布图哈萨尔的后裔。他们进入青海后便留下放牧繁衍生息,发展至今。
 楼主| 发表于 2013-7-28 10:47 | 显示全部楼层
所以依然不能排除此人是黄金家族的可能性,Q哥估计又有材料可说了,原来蒙古的大汗也有可能是Q类型的,不愧是天生的王者,国度从你而立,君王从你而出
发表于 2013-7-28 10:53 | 显示全部楼层
资助过一位青海蒙古族,自述哈萨尔后裔,结果是R1a1。
 楼主| 发表于 2013-7-28 10:55 | 显示全部楼层
青海蒙古人主要是和硕特,统治阶层自称哈布图哈萨尔后裔,不过主要民众不是,青海蒙古族第一大单倍群是D3a,显示了他们与当地藏族游牧民的融合,M120也有可能来自藏族吧,因为M120似乎在藏族中普遍有些比例的
sahaliyan 发表于 2013-7-28 10:49
青海蒙古来自青海藏族的可能性不大吧,从已有的数据看,“Genetic analysis of 17 Y-chromosomal STRs haplotypes of Chinese Tibetan ethnic group residing in Qinghai province of China”这个研究中,167个青海藏族中一例Q都没有的。
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:05 | 显示全部楼层
国内一些医学文献显示国内的Q族群有生殖缺陷,可能是数量减少的原因之一。
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:12 | 显示全部楼层
从外蒙200人的数据看,外蒙的Q=5/200=2.5%,藏族的大样本数据中Q的比例是1.23%。
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:30 | 显示全部楼层
就是M120藏族和外蒙应该是不相上下的极低。
另外,国内的一些关于Y染色体缺陷所致的少精症无精症等生殖缺陷研究,对于Q单倍型是没有细分的,不过按照分子人类学的文献,国内的Q尤其是汉人是以M120为多数的,国内的Q生殖缺陷研究基本可以等同于M120的研究,这个肯定与美洲的那些占主体的Q不是同一类型的。
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:35 | 显示全部楼层
本帖最后由 风虎云龙 于 2013-7-28 11:37 编辑

按照复旦的大样本数据,汉人Q总体比例才2.3%,想想其中的M120又能比蒙古族、藏族显著高多少呢?外蒙Q是2.5%
藏族Q是1.23%
汉人Q是2.3%
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:47 | 显示全部楼层
汉人的Q总数高于蒙古族和藏族的各自Q总数,这个没有问题,但是我真的看不出其中汉人与藏蒙M120的频率相比,其中的显著性
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:50 | 显示全部楼层
你有汉蒙藏三者的M120各自分布频率的数据吗?
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:55 | 显示全部楼层
连复旦都只能给Q类型测试者分到首字母的承诺,就凭咱们掌握的这点资料就能够就M120在汉蒙藏的分布情况谈谁比谁显著?
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:56 | 显示全部楼层
这个阶段,现有的资料只能谈谈Q吧
 楼主| 发表于 2013-7-28 11:59 | 显示全部楼层
蒙古大多数数据M120的比例为0,只有少量存在,但是比例也极低
汉人,见云南所的文章,有些北方省份相当高,比如河南,讨论汉人的时候应将南方去除掉,不然不是一个数量级,不好比较
sahaliyan 发表于 2013-7-28 11:54
南方汉人不是汉?你这话让闽南潮汕广东那群M117情何以堪?讨论M117、F444的时候,南方汉人甚至是南方少民的频率都能作为参照,到讨论M120的时候,就得把这些人撇开,这是什么道理呢?
 楼主| 发表于 2013-7-28 12:03 | 显示全部楼层
若按数量级,藏族有640万,蒙古族有800多万,这点量都不及汉人一个中上等的地市人口。
 楼主| 发表于 2013-7-28 12:06 | 显示全部楼层
复旦的大样本F444为13.2%数据,能算作是什么北方汉族的数据?
 楼主| 发表于 2013-7-28 12:21 | 显示全部楼层
这样的话,闽南潮汕广东那群M117爷们们倒是也有依据可凭了,F444的比例以石家庄汉为准的话,M117的比例不妨选取闽南的厦、漳、泉三地,接近40%的比例呢?这样来看的话什么中原、西北、华北、华东、西南的汉藏人群的M117都很低。
 楼主| 发表于 2013-7-28 12:23 | 显示全部楼层
南方的F444低是因为石家庄的F444比例是15%而南方不及,中原、西北、华北、华东、西南的汉藏人群的M117低,是因为闽南的厦、漳、泉三地的比例接近40%,而上述这些地方不及。
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